Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN0

LCOR, Ligand-dependent corepressor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCORQ96JN0 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LCORQ96JN0 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LCORQ96JN0 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LCORQ96JN0 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LCORQ96JN0 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LCORQ96JN0 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LCORQ96JN0 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LCORQ96JN0 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
LCORQ96JN0 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LCORQ96JN0 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
LCORQ96JN0 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
LCORQ96JN0 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LCORQ96JN0 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LCORQ96JN0 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LCORQ96JN0 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LCORQ96JN0 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LCORQ96JN0 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
LCORQ96JN0 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LCORQ96JN0 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LCORQ96JN0 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LCORQ96JN0 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LCORQ96JN0 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LCORQ96JN0 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LCORQ96JN0 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LCORQ96JN0 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
LCORQ96JN0 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LCORQ96JN0 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LCORQ96JN0 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LCORQ96JN0 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LCORQ96JN0 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LCORQ96JN0 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LCORQ96JN0 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LCORQ96JN0 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LCORQ96JN0 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LCORQ96JN0 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LCORQ96JN0 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LCORQ96JN0 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LCORQ96JN0 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LCORQ96JN0 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LCORQ96JN0 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LCORQ96JN0 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LCORQ96JN0 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LCORQ96JN0 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LCORQ96JN0 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LCORQ96JN0 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LCORQ96JN0 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LCORQ96JN0 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LCORQ96JN0 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LCORQ96JN0 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LCORQ96JN0 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LCORQ96JN0 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LCORQ96JN0 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LCORQ96JN0 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LCORQ96JN0 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LCORQ96JN0 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LCORQ96JN0 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LCORQ96JN0 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LCORQ96JN0 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LCORQ96JN0 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LCORQ96JN0 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LCORQ96JN0 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LCORQ96JN0 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LCORQ96JN0 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LCORQ96JN0 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LCORQ96JN0 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LCORQ96JN0 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LCORQ96JN0 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LCORQ96JN0 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
LCORQ96JN0 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
LCORQ96JN0 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LCORQ96JN0 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LCORQ96JN0 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LCORQ96JN0 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LCORQ96JN0 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LCORQ96JN0 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LCORQ96JN0 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
LCORQ96JN0 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LCORQ96JN0 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
LCORQ96JN0 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LCORQ96JN0 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LCORQ96JN0 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
LCORQ96JN0 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
LCORQ96JN0 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LCORQ96JN0 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LCORQ96JN0 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LCORQ96JN0 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LCORQ96JN0 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LCORQ96JN0 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LCORQ96JN0 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LCORQ96JN0 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LCORQ96JN0 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LCORQ96JN0 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LCORQ96JN0 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LCORQ96JN0 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LCORQ96JN0 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LCORQ96JN0 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LCORQ96JN0 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LCORQ96JN0 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LCORQ96JN0 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LCORQ96JN0 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms