Protein–RNA interactions for Protein: Q96CC6

RHBDF1, Inactive rhomboid protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDF1Q96CC6 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms