Protein–RNA interactions for Protein: Q93008

USP9X, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,570 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9XQ93008 AC093567.1-201ENST00000590649 877 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 AC069208.1-205ENST00000456299 576 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 AL138720.1-201ENST00000629853 778 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 AC027139.1-201ENST00000565286 951 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 AC245884.1-201ENST00000457113 529 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 MIR6816-201ENST00000620368 66 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 CTSL-202ENST00000342020 933 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
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