Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBXN4Q92575 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBXN4Q92575 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBXN4Q92575 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBXN4Q92575 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBXN4Q92575 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBXN4Q92575 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBXN4Q92575 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBXN4Q92575 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBXN4Q92575 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBXN4Q92575 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBXN4Q92575 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBXN4Q92575 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBXN4Q92575 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBXN4Q92575 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBXN4Q92575 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBXN4Q92575 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBXN4Q92575 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBXN4Q92575 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBXN4Q92575 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBXN4Q92575 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBXN4Q92575 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBXN4Q92575 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBXN4Q92575 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBXN4Q92575 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBXN4Q92575 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBXN4Q92575 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBXN4Q92575 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBXN4Q92575 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBXN4Q92575 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBXN4Q92575 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBXN4Q92575 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBXN4Q92575 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBXN4Q92575 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBXN4Q92575 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBXN4Q92575 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBXN4Q92575 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBXN4Q92575 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBXN4Q92575 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
UBXN4Q92575 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
UBXN4Q92575 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBXN4Q92575 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBXN4Q92575 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
UBXN4Q92575 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBXN4Q92575 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBXN4Q92575 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBXN4Q92575 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBXN4Q92575 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBXN4Q92575 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBXN4Q92575 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBXN4Q92575 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBXN4Q92575 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBXN4Q92575 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBXN4Q92575 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBXN4Q92575 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBXN4Q92575 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBXN4Q92575 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBXN4Q92575 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBXN4Q92575 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBXN4Q92575 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBXN4Q92575 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBXN4Q92575 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBXN4Q92575 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBXN4Q92575 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBXN4Q92575 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBXN4Q92575 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBXN4Q92575 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
UBXN4Q92575 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBXN4Q92575 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBXN4Q92575 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBXN4Q92575 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBXN4Q92575 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
UBXN4Q92575 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBXN4Q92575 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBXN4Q92575 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBXN4Q92575 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBXN4Q92575 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBXN4Q92575 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBXN4Q92575 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBXN4Q92575 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBXN4Q92575 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBXN4Q92575 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
UBXN4Q92575 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBXN4Q92575 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBXN4Q92575 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBXN4Q92575 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBXN4Q92575 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBXN4Q92575 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBXN4Q92575 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBXN4Q92575 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBXN4Q92575 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBXN4Q92575 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBXN4Q92575 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBXN4Q92575 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBXN4Q92575 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBXN4Q92575 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBXN4Q92575 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBXN4Q92575 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBXN4Q92575 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBXN4Q92575 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms