Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TOPBP1Q92547 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TOPBP1Q92547 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TOPBP1Q92547 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TOPBP1Q92547 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TOPBP1Q92547 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TOPBP1Q92547 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TOPBP1Q92547 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TOPBP1Q92547 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TOPBP1Q92547 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TOPBP1Q92547 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TOPBP1Q92547 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TOPBP1Q92547 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TOPBP1Q92547 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
TOPBP1Q92547 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TOPBP1Q92547 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TOPBP1Q92547 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
TOPBP1Q92547 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TOPBP1Q92547 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TOPBP1Q92547 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
TOPBP1Q92547 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TOPBP1Q92547 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TOPBP1Q92547 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
TOPBP1Q92547 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TOPBP1Q92547 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TOPBP1Q92547 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TOPBP1Q92547 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TOPBP1Q92547 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TOPBP1Q92547 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TOPBP1Q92547 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TOPBP1Q92547 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
TOPBP1Q92547 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TOPBP1Q92547 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TOPBP1Q92547 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TOPBP1Q92547 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TOPBP1Q92547 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TOPBP1Q92547 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
TOPBP1Q92547 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TOPBP1Q92547 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TOPBP1Q92547 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TOPBP1Q92547 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TOPBP1Q92547 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TOPBP1Q92547 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TOPBP1Q92547 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TOPBP1Q92547 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TOPBP1Q92547 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TOPBP1Q92547 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TOPBP1Q92547 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TOPBP1Q92547 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TOPBP1Q92547 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TOPBP1Q92547 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TOPBP1Q92547 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
TOPBP1Q92547 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TOPBP1Q92547 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TOPBP1Q92547 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TOPBP1Q92547 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TOPBP1Q92547 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TOPBP1Q92547 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TOPBP1Q92547 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TOPBP1Q92547 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TOPBP1Q92547 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TOPBP1Q92547 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TOPBP1Q92547 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TOPBP1Q92547 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TOPBP1Q92547 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TOPBP1Q92547 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TOPBP1Q92547 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TOPBP1Q92547 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TOPBP1Q92547 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TOPBP1Q92547 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TOPBP1Q92547 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
TOPBP1Q92547 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TOPBP1Q92547 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TOPBP1Q92547 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
TOPBP1Q92547 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TOPBP1Q92547 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TOPBP1Q92547 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TOPBP1Q92547 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TOPBP1Q92547 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TOPBP1Q92547 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
TOPBP1Q92547 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TOPBP1Q92547 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TOPBP1Q92547 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TOPBP1Q92547 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TOPBP1Q92547 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TOPBP1Q92547 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TOPBP1Q92547 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TOPBP1Q92547 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TOPBP1Q92547 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TOPBP1Q92547 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TOPBP1Q92547 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
TOPBP1Q92547 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TOPBP1Q92547 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
TOPBP1Q92547 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
TOPBP1Q92547 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TOPBP1Q92547 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
TOPBP1Q92547 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
TOPBP1Q92547 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
TOPBP1Q92547 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TOPBP1Q92547 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms