Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC6

COPS9, COP9 signalosome complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS9Q8WXC6 STARD8-203ENST00000374599 4841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 CELF1-204ENST00000395290 7666 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 ABI2-202ENST00000261017 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 XIRP1-201ENST00000340369 6460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 DMBT1-201ENST00000330163 5802 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 DMBT1-206ENST00000368956 5802 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 PTCD1-201ENST00000292478 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 IKZF1-203ENST00000346667 5376 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 WNK1-209ENST00000537687 11232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 CD38-201ENST00000226279 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 C15orf40-201ENST00000304177 11244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 CCDC18-203ENST00000401026 4552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC10.74□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 AHI1-201ENST00000265602 4335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 FAM122B-202ENST00000343004 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 NUMA1-205ENST00000393695 7343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 ZHX2-201ENST00000314393 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 NTNG1-204ENST00000370067 4628 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 PCCB-210ENST00000471595 6090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 PTPRN2-203ENST00000389418 4706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 SDC3-201ENST00000336798 6392 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms