Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFH5

NUP35, Nucleoporin NUP53, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP35Q8NFH5 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
NUP35Q8NFH5 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NUP35Q8NFH5 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NUP35Q8NFH5 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
NUP35Q8NFH5 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
NUP35Q8NFH5 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
NUP35Q8NFH5 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NUP35Q8NFH5 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NUP35Q8NFH5 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
NUP35Q8NFH5 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NUP35Q8NFH5 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NUP35Q8NFH5 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
NUP35Q8NFH5 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
NUP35Q8NFH5 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NUP35Q8NFH5 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NUP35Q8NFH5 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
NUP35Q8NFH5 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NUP35Q8NFH5 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NUP35Q8NFH5 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NUP35Q8NFH5 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
NUP35Q8NFH5 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
NUP35Q8NFH5 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
NUP35Q8NFH5 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NUP35Q8NFH5 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
NUP35Q8NFH5 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NUP35Q8NFH5 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NUP35Q8NFH5 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NUP35Q8NFH5 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
NUP35Q8NFH5 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NUP35Q8NFH5 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NUP35Q8NFH5 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
NUP35Q8NFH5 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NUP35Q8NFH5 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NUP35Q8NFH5 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NUP35Q8NFH5 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NUP35Q8NFH5 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
NUP35Q8NFH5 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NUP35Q8NFH5 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NUP35Q8NFH5 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
NUP35Q8NFH5 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NUP35Q8NFH5 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
NUP35Q8NFH5 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
NUP35Q8NFH5 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NUP35Q8NFH5 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NUP35Q8NFH5 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NUP35Q8NFH5 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NUP35Q8NFH5 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NUP35Q8NFH5 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NUP35Q8NFH5 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NUP35Q8NFH5 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NUP35Q8NFH5 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NUP35Q8NFH5 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NUP35Q8NFH5 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NUP35Q8NFH5 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
NUP35Q8NFH5 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
NUP35Q8NFH5 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NUP35Q8NFH5 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NUP35Q8NFH5 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NUP35Q8NFH5 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NUP35Q8NFH5 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
NUP35Q8NFH5 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
NUP35Q8NFH5 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
NUP35Q8NFH5 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NUP35Q8NFH5 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
NUP35Q8NFH5 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
NUP35Q8NFH5 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
NUP35Q8NFH5 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
NUP35Q8NFH5 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
NUP35Q8NFH5 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
NUP35Q8NFH5 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
NUP35Q8NFH5 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
NUP35Q8NFH5 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
NUP35Q8NFH5 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NUP35Q8NFH5 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NUP35Q8NFH5 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
NUP35Q8NFH5 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
NUP35Q8NFH5 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
NUP35Q8NFH5 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NUP35Q8NFH5 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
NUP35Q8NFH5 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
NUP35Q8NFH5 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NUP35Q8NFH5 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
NUP35Q8NFH5 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
NUP35Q8NFH5 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
NUP35Q8NFH5 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
NUP35Q8NFH5 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
NUP35Q8NFH5 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NUP35Q8NFH5 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NUP35Q8NFH5 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NUP35Q8NFH5 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NUP35Q8NFH5 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NUP35Q8NFH5 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NUP35Q8NFH5 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
NUP35Q8NFH5 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NUP35Q8NFH5 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
NUP35Q8NFH5 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NUP35Q8NFH5 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NUP35Q8NFH5 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NUP35Q8NFH5 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
NUP35Q8NFH5 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms