Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6Q1

TMCO5A, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5A, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO5AQ8N6Q1 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMCO5AQ8N6Q1 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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TMCO5AQ8N6Q1 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMCO5AQ8N6Q1 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMCO5AQ8N6Q1 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMCO5AQ8N6Q1 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMCO5AQ8N6Q1 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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TMCO5AQ8N6Q1 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMCO5AQ8N6Q1 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TMCO5AQ8N6Q1 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMCO5AQ8N6Q1 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMCO5AQ8N6Q1 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMCO5AQ8N6Q1 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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TMCO5AQ8N6Q1 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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TMCO5AQ8N6Q1 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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TMCO5AQ8N6Q1 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMCO5AQ8N6Q1 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMCO5AQ8N6Q1 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMCO5AQ8N6Q1 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMCO5AQ8N6Q1 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMCO5AQ8N6Q1 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMCO5AQ8N6Q1 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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TMCO5AQ8N6Q1 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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TMCO5AQ8N6Q1 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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TMCO5AQ8N6Q1 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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TMCO5AQ8N6Q1 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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TMCO5AQ8N6Q1 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMCO5AQ8N6Q1 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMCO5AQ8N6Q1 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMCO5AQ8N6Q1 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMCO5AQ8N6Q1 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMCO5AQ8N6Q1 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMCO5AQ8N6Q1 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMCO5AQ8N6Q1 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMCO5AQ8N6Q1 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMCO5AQ8N6Q1 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMCO5AQ8N6Q1 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMCO5AQ8N6Q1 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMCO5AQ8N6Q1 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMCO5AQ8N6Q1 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TMCO5AQ8N6Q1 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMCO5AQ8N6Q1 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMCO5AQ8N6Q1 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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