Protein–RNA interactions for Protein: Q8N474

SFRP1, Secreted frizzled-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP1Q8N474 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SFRP1Q8N474 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SFRP1Q8N474 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SFRP1Q8N474 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SFRP1Q8N474 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SFRP1Q8N474 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SFRP1Q8N474 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SFRP1Q8N474 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SFRP1Q8N474 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SFRP1Q8N474 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SFRP1Q8N474 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SFRP1Q8N474 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SFRP1Q8N474 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SFRP1Q8N474 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SFRP1Q8N474 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SFRP1Q8N474 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SFRP1Q8N474 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SFRP1Q8N474 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SFRP1Q8N474 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SFRP1Q8N474 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SFRP1Q8N474 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SFRP1Q8N474 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SFRP1Q8N474 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SFRP1Q8N474 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SFRP1Q8N474 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SFRP1Q8N474 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SFRP1Q8N474 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SFRP1Q8N474 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SFRP1Q8N474 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SFRP1Q8N474 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SFRP1Q8N474 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SFRP1Q8N474 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SFRP1Q8N474 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SFRP1Q8N474 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SFRP1Q8N474 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SFRP1Q8N474 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SFRP1Q8N474 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SFRP1Q8N474 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SFRP1Q8N474 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFRP1Q8N474 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFRP1Q8N474 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFRP1Q8N474 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFRP1Q8N474 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFRP1Q8N474 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFRP1Q8N474 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFRP1Q8N474 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFRP1Q8N474 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFRP1Q8N474 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFRP1Q8N474 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFRP1Q8N474 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFRP1Q8N474 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFRP1Q8N474 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFRP1Q8N474 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFRP1Q8N474 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFRP1Q8N474 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFRP1Q8N474 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFRP1Q8N474 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFRP1Q8N474 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFRP1Q8N474 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SFRP1Q8N474 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFRP1Q8N474 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFRP1Q8N474 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFRP1Q8N474 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFRP1Q8N474 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SFRP1Q8N474 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFRP1Q8N474 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFRP1Q8N474 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFRP1Q8N474 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFRP1Q8N474 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFRP1Q8N474 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFRP1Q8N474 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFRP1Q8N474 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFRP1Q8N474 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFRP1Q8N474 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFRP1Q8N474 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFRP1Q8N474 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFRP1Q8N474 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFRP1Q8N474 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFRP1Q8N474 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFRP1Q8N474 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFRP1Q8N474 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFRP1Q8N474 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFRP1Q8N474 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFRP1Q8N474 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFRP1Q8N474 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFRP1Q8N474 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFRP1Q8N474 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFRP1Q8N474 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFRP1Q8N474 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFRP1Q8N474 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFRP1Q8N474 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFRP1Q8N474 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFRP1Q8N474 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFRP1Q8N474 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFRP1Q8N474 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFRP1Q8N474 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFRP1Q8N474 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFRP1Q8N474 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFRP1Q8N474 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFRP1Q8N474 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms