Protein–RNA interactions for Protein: Q8N283

ANKRD35, Ankyrin repeat domain-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD35Q8N283 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ANKRD35Q8N283 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ANKRD35Q8N283 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ANKRD35Q8N283 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ANKRD35Q8N283 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ANKRD35Q8N283 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ANKRD35Q8N283 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ANKRD35Q8N283 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ANKRD35Q8N283 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ANKRD35Q8N283 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ANKRD35Q8N283 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD35Q8N283 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD35Q8N283 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD35Q8N283 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD35Q8N283 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD35Q8N283 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD35Q8N283 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD35Q8N283 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD35Q8N283 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD35Q8N283 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD35Q8N283 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD35Q8N283 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD35Q8N283 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD35Q8N283 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD35Q8N283 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD35Q8N283 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD35Q8N283 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD35Q8N283 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD35Q8N283 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD35Q8N283 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD35Q8N283 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD35Q8N283 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD35Q8N283 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD35Q8N283 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD35Q8N283 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD35Q8N283 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD35Q8N283 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD35Q8N283 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD35Q8N283 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD35Q8N283 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD35Q8N283 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD35Q8N283 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD35Q8N283 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD35Q8N283 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD35Q8N283 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD35Q8N283 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD35Q8N283 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD35Q8N283 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD35Q8N283 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD35Q8N283 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD35Q8N283 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD35Q8N283 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD35Q8N283 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD35Q8N283 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD35Q8N283 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD35Q8N283 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD35Q8N283 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD35Q8N283 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD35Q8N283 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD35Q8N283 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD35Q8N283 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD35Q8N283 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD35Q8N283 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD35Q8N283 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD35Q8N283 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD35Q8N283 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD35Q8N283 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD35Q8N283 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD35Q8N283 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD35Q8N283 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD35Q8N283 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD35Q8N283 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD35Q8N283 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD35Q8N283 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD35Q8N283 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD35Q8N283 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD35Q8N283 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD35Q8N283 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD35Q8N283 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD35Q8N283 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD35Q8N283 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD35Q8N283 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD35Q8N283 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD35Q8N283 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD35Q8N283 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD35Q8N283 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD35Q8N283 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD35Q8N283 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD35Q8N283 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD35Q8N283 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD35Q8N283 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD35Q8N283 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD35Q8N283 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD35Q8N283 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD35Q8N283 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD35Q8N283 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD35Q8N283 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ANKRD35Q8N283 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ANKRD35Q8N283 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ANKRD35Q8N283 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms