Protein–RNA interactions for Protein: Q86YW5

TREML1, Trem-like transcript 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREML1Q86YW5 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms