Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.4 ms