Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms