Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH8

DUX4L9, Double homeobox protein 4C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4L9Q6RFH8 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC13.18□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC13.17□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.16□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC13.16□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC13.16□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
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