Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NANOGP8Q6NSW7 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NANOGP8Q6NSW7 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NANOGP8Q6NSW7 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NANOGP8Q6NSW7 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NANOGP8Q6NSW7 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
NANOGP8Q6NSW7 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
NANOGP8Q6NSW7 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NANOGP8Q6NSW7 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NANOGP8Q6NSW7 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
NANOGP8Q6NSW7 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
NANOGP8Q6NSW7 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NANOGP8Q6NSW7 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NANOGP8Q6NSW7 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NANOGP8Q6NSW7 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NANOGP8Q6NSW7 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NANOGP8Q6NSW7 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NANOGP8Q6NSW7 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NANOGP8Q6NSW7 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NANOGP8Q6NSW7 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NANOGP8Q6NSW7 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NANOGP8Q6NSW7 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NANOGP8Q6NSW7 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
NANOGP8Q6NSW7 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NANOGP8Q6NSW7 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NANOGP8Q6NSW7 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NANOGP8Q6NSW7 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NANOGP8Q6NSW7 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NANOGP8Q6NSW7 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NANOGP8Q6NSW7 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NANOGP8Q6NSW7 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NANOGP8Q6NSW7 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NANOGP8Q6NSW7 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NANOGP8Q6NSW7 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NANOGP8Q6NSW7 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NANOGP8Q6NSW7 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NANOGP8Q6NSW7 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NANOGP8Q6NSW7 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NANOGP8Q6NSW7 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NANOGP8Q6NSW7 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NANOGP8Q6NSW7 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NANOGP8Q6NSW7 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NANOGP8Q6NSW7 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NANOGP8Q6NSW7 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NANOGP8Q6NSW7 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NANOGP8Q6NSW7 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NANOGP8Q6NSW7 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NANOGP8Q6NSW7 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NANOGP8Q6NSW7 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NANOGP8Q6NSW7 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NANOGP8Q6NSW7 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NANOGP8Q6NSW7 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NANOGP8Q6NSW7 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NANOGP8Q6NSW7 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NANOGP8Q6NSW7 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NANOGP8Q6NSW7 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NANOGP8Q6NSW7 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NANOGP8Q6NSW7 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NANOGP8Q6NSW7 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NANOGP8Q6NSW7 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NANOGP8Q6NSW7 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NANOGP8Q6NSW7 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NANOGP8Q6NSW7 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NANOGP8Q6NSW7 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NANOGP8Q6NSW7 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NANOGP8Q6NSW7 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NANOGP8Q6NSW7 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NANOGP8Q6NSW7 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NANOGP8Q6NSW7 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NANOGP8Q6NSW7 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NANOGP8Q6NSW7 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NANOGP8Q6NSW7 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NANOGP8Q6NSW7 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NANOGP8Q6NSW7 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NANOGP8Q6NSW7 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NANOGP8Q6NSW7 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NANOGP8Q6NSW7 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NANOGP8Q6NSW7 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NANOGP8Q6NSW7 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NANOGP8Q6NSW7 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NANOGP8Q6NSW7 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NANOGP8Q6NSW7 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NANOGP8Q6NSW7 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NANOGP8Q6NSW7 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NANOGP8Q6NSW7 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NANOGP8Q6NSW7 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NANOGP8Q6NSW7 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NANOGP8Q6NSW7 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NANOGP8Q6NSW7 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NANOGP8Q6NSW7 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NANOGP8Q6NSW7 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NANOGP8Q6NSW7 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NANOGP8Q6NSW7 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NANOGP8Q6NSW7 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NANOGP8Q6NSW7 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NANOGP8Q6NSW7 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
NANOGP8Q6NSW7 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NANOGP8Q6NSW7 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NANOGP8Q6NSW7 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NANOGP8Q6NSW7 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms