Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT98

PRAMEF20, PRAME family member 20, humanhuman

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Length 475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF20Q5VT98 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRAMEF20Q5VT98 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRAMEF20Q5VT98 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRAMEF20Q5VT98 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRAMEF20Q5VT98 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRAMEF20Q5VT98 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRAMEF20Q5VT98 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRAMEF20Q5VT98 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRAMEF20Q5VT98 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRAMEF20Q5VT98 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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PRAMEF20Q5VT98 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRAMEF20Q5VT98 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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PRAMEF20Q5VT98 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRAMEF20Q5VT98 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRAMEF20Q5VT98 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRAMEF20Q5VT98 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRAMEF20Q5VT98 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRAMEF20Q5VT98 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRAMEF20Q5VT98 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRAMEF20Q5VT98 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRAMEF20Q5VT98 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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PRAMEF20Q5VT98 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRAMEF20Q5VT98 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRAMEF20Q5VT98 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRAMEF20Q5VT98 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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PRAMEF20Q5VT98 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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PRAMEF20Q5VT98 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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PRAMEF20Q5VT98 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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PRAMEF20Q5VT98 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRAMEF20Q5VT98 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRAMEF20Q5VT98 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRAMEF20Q5VT98 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRAMEF20Q5VT98 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRAMEF20Q5VT98 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRAMEF20Q5VT98 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRAMEF20Q5VT98 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRAMEF20Q5VT98 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRAMEF20Q5VT98 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PRAMEF20Q5VT98 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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