Protein–RNA interactions for Protein: Q5RL73

RBM48, RNA-binding protein 48, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM48Q5RL73 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RBM48Q5RL73 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RBM48Q5RL73 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RBM48Q5RL73 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RBM48Q5RL73 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RBM48Q5RL73 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RBM48Q5RL73 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RBM48Q5RL73 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RBM48Q5RL73 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RBM48Q5RL73 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RBM48Q5RL73 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RBM48Q5RL73 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RBM48Q5RL73 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RBM48Q5RL73 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RBM48Q5RL73 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RBM48Q5RL73 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RBM48Q5RL73 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RBM48Q5RL73 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RBM48Q5RL73 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RBM48Q5RL73 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RBM48Q5RL73 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RBM48Q5RL73 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RBM48Q5RL73 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RBM48Q5RL73 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RBM48Q5RL73 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RBM48Q5RL73 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RBM48Q5RL73 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RBM48Q5RL73 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RBM48Q5RL73 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RBM48Q5RL73 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RBM48Q5RL73 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RBM48Q5RL73 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RBM48Q5RL73 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RBM48Q5RL73 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RBM48Q5RL73 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RBM48Q5RL73 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RBM48Q5RL73 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
RBM48Q5RL73 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RBM48Q5RL73 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RBM48Q5RL73 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RBM48Q5RL73 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RBM48Q5RL73 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RBM48Q5RL73 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RBM48Q5RL73 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RBM48Q5RL73 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RBM48Q5RL73 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RBM48Q5RL73 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RBM48Q5RL73 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RBM48Q5RL73 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RBM48Q5RL73 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RBM48Q5RL73 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RBM48Q5RL73 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RBM48Q5RL73 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RBM48Q5RL73 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RBM48Q5RL73 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RBM48Q5RL73 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
RBM48Q5RL73 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RBM48Q5RL73 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
RBM48Q5RL73 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RBM48Q5RL73 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
RBM48Q5RL73 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RBM48Q5RL73 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RBM48Q5RL73 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RBM48Q5RL73 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RBM48Q5RL73 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RBM48Q5RL73 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RBM48Q5RL73 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
RBM48Q5RL73 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RBM48Q5RL73 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RBM48Q5RL73 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RBM48Q5RL73 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RBM48Q5RL73 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RBM48Q5RL73 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RBM48Q5RL73 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RBM48Q5RL73 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RBM48Q5RL73 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RBM48Q5RL73 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RBM48Q5RL73 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RBM48Q5RL73 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RBM48Q5RL73 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RBM48Q5RL73 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RBM48Q5RL73 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RBM48Q5RL73 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RBM48Q5RL73 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RBM48Q5RL73 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RBM48Q5RL73 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RBM48Q5RL73 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RBM48Q5RL73 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RBM48Q5RL73 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
RBM48Q5RL73 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RBM48Q5RL73 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RBM48Q5RL73 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RBM48Q5RL73 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RBM48Q5RL73 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RBM48Q5RL73 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RBM48Q5RL73 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RBM48Q5RL73 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RBM48Q5RL73 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RBM48Q5RL73 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RBM48Q5RL73 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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