Protein–RNA interactions for Protein: Q53S48

ALF, STON1-GTF2A1L readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALFQ53S48 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ALFQ53S48 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms