Protein–RNA interactions for Protein: Q53H82

LACTB2, Endoribonuclease LACTB2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LACTB2Q53H82 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms