Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 MGA-212ENST00000619521 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 LINC01922-201ENST00000562582 719 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms