Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC96Q2M329 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms