Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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