Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
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