Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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PDK4Q16654 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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PDK4Q16654 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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