Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms