Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 CHRFAM7A-201ENST00000299847 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 ZNF862-201ENST00000223210 6950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 FLNA-201ENST00000344736 7932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 FUT8-203ENST00000360689 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 KDM5C-208ENST00000452825 6096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 NEK9-201ENST00000238616 8310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms