Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
USF2Q15853 CEP131-201ENST00000269392 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
USF2Q15853 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
USF2Q15853 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
USF2Q15853 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
USF2Q15853 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
USF2Q15853 ABCC6-201ENST00000205557 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
USF2Q15853 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
USF2Q15853 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
USF2Q15853 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
USF2Q15853 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
USF2Q15853 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
USF2Q15853 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
USF2Q15853 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
USF2Q15853 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
USF2Q15853 ARHGAP20-201ENST00000260283 6189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
USF2Q15853 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
USF2Q15853 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
USF2Q15853 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
USF2Q15853 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
USF2Q15853 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
USF2Q15853 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
USF2Q15853 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
USF2Q15853 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
USF2Q15853 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
USF2Q15853 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
USF2Q15853 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
USF2Q15853 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC12.94□□□□□ -0.34
USF2Q15853 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC12.94□□□□□ -0.34
USF2Q15853 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
USF2Q15853 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
USF2Q15853 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
USF2Q15853 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
USF2Q15853 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
USF2Q15853 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC12.94□□□□□ -0.34
USF2Q15853 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
USF2Q15853 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
USF2Q15853 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
USF2Q15853 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
USF2Q15853 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
USF2Q15853 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
USF2Q15853 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
USF2Q15853 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
USF2Q15853 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
USF2Q15853 GAB1-202ENST00000262995 7981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
USF2Q15853 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
USF2Q15853 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
USF2Q15853 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
USF2Q15853 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC12.94□□□□□ -0.34
USF2Q15853 CIITA-213ENST00000618327 4657 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
USF2Q15853 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
USF2Q15853 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
USF2Q15853 WDR26-201ENST00000414423 6872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
USF2Q15853 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
USF2Q15853 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
USF2Q15853 PRR12-201ENST00000418929 6955 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
USF2Q15853 TLL2-201ENST00000357947 6756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
USF2Q15853 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
USF2Q15853 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
USF2Q15853 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
USF2Q15853 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
USF2Q15853 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
USF2Q15853 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
USF2Q15853 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
USF2Q15853 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
USF2Q15853 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
USF2Q15853 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
USF2Q15853 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
USF2Q15853 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
USF2Q15853 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
USF2Q15853 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
USF2Q15853 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
USF2Q15853 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
USF2Q15853 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
USF2Q15853 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
USF2Q15853 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
USF2Q15853 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
USF2Q15853 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
USF2Q15853 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
USF2Q15853 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
USF2Q15853 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
USF2Q15853 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
USF2Q15853 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
USF2Q15853 OTP-201ENST00000306422 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
USF2Q15853 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
USF2Q15853 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
USF2Q15853 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
USF2Q15853 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
USF2Q15853 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
USF2Q15853 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
USF2Q15853 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
USF2Q15853 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
USF2Q15853 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
USF2Q15853 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
USF2Q15853 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC12.93□□□□□ -0.34
USF2Q15853 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
USF2Q15853 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
USF2Q15853 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
USF2Q15853 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
USF2Q15853 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
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