Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIP13Q15645 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
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