Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 PPP2R5E-201ENST00000337537 6659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SS18Q15532 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SS18Q15532 PAG1-201ENST00000220597 10744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SS18Q15532 EPB41L1-202ENST00000338074 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SS18Q15532 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SS18Q15532 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SS18Q15532 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SS18Q15532 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SS18Q15532 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
SS18Q15532 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
SS18Q15532 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SS18Q15532 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SS18Q15532 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SS18Q15532 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
SS18Q15532 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
SS18Q15532 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SS18Q15532 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
SS18Q15532 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SS18Q15532 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SS18Q15532 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SS18Q15532 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SS18Q15532 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SS18Q15532 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SS18Q15532 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
SS18Q15532 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SS18Q15532 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SS18Q15532 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SS18Q15532 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SS18Q15532 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SS18Q15532 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SS18Q15532 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SS18Q15532 SEMA6D-208ENST00000558014 6028 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SS18Q15532 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SS18Q15532 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SS18Q15532 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SS18Q15532 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SS18Q15532 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SS18Q15532 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SS18Q15532 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SS18Q15532 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SS18Q15532 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SS18Q15532 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SS18Q15532 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SS18Q15532 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SS18Q15532 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SS18Q15532 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SS18Q15532 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SS18Q15532 ABCC6-201ENST00000205557 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SS18Q15532 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SS18Q15532 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SS18Q15532 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SS18Q15532 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SS18Q15532 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SS18Q15532 AGL-203ENST00000361915 7368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SS18Q15532 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SS18Q15532 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SS18Q15532 FLNC-202ENST00000346177 9042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SS18Q15532 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SS18Q15532 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SS18Q15532 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SS18Q15532 SLC4A7-203ENST00000425128 7970 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SS18Q15532 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SS18Q15532 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SS18Q15532 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SS18Q15532 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SS18Q15532 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SS18Q15532 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SS18Q15532 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SS18Q15532 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SS18Q15532 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
SS18Q15532 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SS18Q15532 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SS18Q15532 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SS18Q15532 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SS18Q15532 CAD-202ENST00000403525 6900 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SS18Q15532 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SS18Q15532 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SS18Q15532 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SS18Q15532 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SS18Q15532 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SS18Q15532 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SS18Q15532 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SS18Q15532 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SS18Q15532 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SS18Q15532 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
SS18Q15532 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SS18Q15532 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SS18Q15532 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SS18Q15532 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SS18Q15532 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SS18Q15532 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SS18Q15532 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SS18Q15532 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SS18Q15532 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
SS18Q15532 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SS18Q15532 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SS18Q15532 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SS18Q15532 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SS18Q15532 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SS18Q15532 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms