Protein–RNA interactions for Protein: Q15075

EEA1, Early endosome antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEA1Q15075 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EEA1Q15075 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EEA1Q15075 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
EEA1Q15075 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
EEA1Q15075 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EEA1Q15075 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
EEA1Q15075 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
EEA1Q15075 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EEA1Q15075 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EEA1Q15075 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EEA1Q15075 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EEA1Q15075 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
EEA1Q15075 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EEA1Q15075 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
EEA1Q15075 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
EEA1Q15075 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
EEA1Q15075 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EEA1Q15075 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
EEA1Q15075 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EEA1Q15075 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EEA1Q15075 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
EEA1Q15075 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EEA1Q15075 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EEA1Q15075 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EEA1Q15075 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EEA1Q15075 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EEA1Q15075 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EEA1Q15075 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EEA1Q15075 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EEA1Q15075 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EEA1Q15075 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EEA1Q15075 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
EEA1Q15075 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EEA1Q15075 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EEA1Q15075 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EEA1Q15075 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EEA1Q15075 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EEA1Q15075 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EEA1Q15075 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
EEA1Q15075 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
EEA1Q15075 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EEA1Q15075 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EEA1Q15075 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EEA1Q15075 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
EEA1Q15075 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EEA1Q15075 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EEA1Q15075 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EEA1Q15075 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EEA1Q15075 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
EEA1Q15075 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EEA1Q15075 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EEA1Q15075 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
EEA1Q15075 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
EEA1Q15075 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
EEA1Q15075 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
EEA1Q15075 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
EEA1Q15075 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
EEA1Q15075 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EEA1Q15075 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EEA1Q15075 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EEA1Q15075 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
EEA1Q15075 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
EEA1Q15075 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EEA1Q15075 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
EEA1Q15075 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EEA1Q15075 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EEA1Q15075 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
EEA1Q15075 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EEA1Q15075 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EEA1Q15075 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EEA1Q15075 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EEA1Q15075 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
EEA1Q15075 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
EEA1Q15075 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
EEA1Q15075 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
EEA1Q15075 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
EEA1Q15075 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
EEA1Q15075 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
EEA1Q15075 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EEA1Q15075 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
EEA1Q15075 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EEA1Q15075 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
EEA1Q15075 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
EEA1Q15075 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EEA1Q15075 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EEA1Q15075 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
EEA1Q15075 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EEA1Q15075 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EEA1Q15075 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EEA1Q15075 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EEA1Q15075 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EEA1Q15075 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EEA1Q15075 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EEA1Q15075 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EEA1Q15075 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EEA1Q15075 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EEA1Q15075 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EEA1Q15075 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EEA1Q15075 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
EEA1Q15075 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
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