Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms