Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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GBX1Q14549 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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GBX1Q14549 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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GBX1Q14549 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBX1Q14549 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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GBX1Q14549 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GBX1Q14549 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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GBX1Q14549 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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GBX1Q14549 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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GBX1Q14549 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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GBX1Q14549 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBX1Q14549 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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GBX1Q14549 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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GBX1Q14549 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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GBX1Q14549 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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GBX1Q14549 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBX1Q14549 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBX1Q14549 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBX1Q14549 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
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GBX1Q14549 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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GBX1Q14549 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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