Protein–RNA interactions for Protein: Q14094

CCNI, Cyclin-I, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNIQ14094 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
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CCNIQ14094 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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CCNIQ14094 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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CCNIQ14094 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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