Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
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