Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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