Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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