Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 AC004973.1-201ENST00000413240 635 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 C3orf38-204ENST00000486971 1259 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 AC018761.2-201ENST00000585496 296 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms