Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNA1SQ13698 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
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