Protein–RNA interactions for Protein: Q13425

SNTB2, Beta-2-syntrophin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTB2Q13425 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SNTB2Q13425 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SNTB2Q13425 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SNTB2Q13425 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SNTB2Q13425 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SNTB2Q13425 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SNTB2Q13425 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SNTB2Q13425 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SNTB2Q13425 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SNTB2Q13425 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SNTB2Q13425 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SNTB2Q13425 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SNTB2Q13425 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SNTB2Q13425 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SNTB2Q13425 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SNTB2Q13425 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SNTB2Q13425 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SNTB2Q13425 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SNTB2Q13425 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SNTB2Q13425 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SNTB2Q13425 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SNTB2Q13425 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SNTB2Q13425 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SNTB2Q13425 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SNTB2Q13425 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SNTB2Q13425 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SNTB2Q13425 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SNTB2Q13425 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SNTB2Q13425 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SNTB2Q13425 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SNTB2Q13425 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
SNTB2Q13425 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SNTB2Q13425 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
SNTB2Q13425 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SNTB2Q13425 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SNTB2Q13425 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
SNTB2Q13425 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SNTB2Q13425 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SNTB2Q13425 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SNTB2Q13425 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SNTB2Q13425 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SNTB2Q13425 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
SNTB2Q13425 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SNTB2Q13425 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SNTB2Q13425 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SNTB2Q13425 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SNTB2Q13425 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
SNTB2Q13425 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SNTB2Q13425 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SNTB2Q13425 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SNTB2Q13425 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SNTB2Q13425 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SNTB2Q13425 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SNTB2Q13425 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SNTB2Q13425 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SNTB2Q13425 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SNTB2Q13425 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SNTB2Q13425 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SNTB2Q13425 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SNTB2Q13425 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SNTB2Q13425 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SNTB2Q13425 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SNTB2Q13425 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SNTB2Q13425 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SNTB2Q13425 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SNTB2Q13425 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SNTB2Q13425 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SNTB2Q13425 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SNTB2Q13425 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SNTB2Q13425 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SNTB2Q13425 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SNTB2Q13425 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SNTB2Q13425 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SNTB2Q13425 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SNTB2Q13425 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SNTB2Q13425 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SNTB2Q13425 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SNTB2Q13425 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SNTB2Q13425 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
SNTB2Q13425 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SNTB2Q13425 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
SNTB2Q13425 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
SNTB2Q13425 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SNTB2Q13425 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
SNTB2Q13425 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SNTB2Q13425 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SNTB2Q13425 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SNTB2Q13425 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SNTB2Q13425 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SNTB2Q13425 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SNTB2Q13425 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SNTB2Q13425 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SNTB2Q13425 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SNTB2Q13425 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SNTB2Q13425 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SNTB2Q13425 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SNTB2Q13425 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SNTB2Q13425 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SNTB2Q13425 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SNTB2Q13425 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms