Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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CSTF3Q12996 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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CSTF3Q12996 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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CSTF3Q12996 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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CSTF3Q12996 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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CSTF3Q12996 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
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CSTF3Q12996 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CSTF3Q12996 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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