Protein–RNA interactions for Protein: Q09472

EP300, Histone acetyltransferase p300, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP300Q09472 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EP300Q09472 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EP300Q09472 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EP300Q09472 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EP300Q09472 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EP300Q09472 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EP300Q09472 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EP300Q09472 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EP300Q09472 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
EP300Q09472 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
EP300Q09472 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EP300Q09472 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
EP300Q09472 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EP300Q09472 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EP300Q09472 ETV2-207ENST00000619399 994 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EP300Q09472 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EP300Q09472 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EP300Q09472 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EP300Q09472 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EP300Q09472 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EP300Q09472 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EP300Q09472 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EP300Q09472 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
EP300Q09472 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EP300Q09472 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EP300Q09472 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EP300Q09472 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EP300Q09472 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EP300Q09472 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EP300Q09472 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EP300Q09472 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EP300Q09472 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EP300Q09472 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EP300Q09472 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EP300Q09472 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
EP300Q09472 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
EP300Q09472 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
EP300Q09472 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EP300Q09472 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EP300Q09472 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EP300Q09472 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EP300Q09472 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EP300Q09472 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EP300Q09472 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EP300Q09472 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EP300Q09472 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EP300Q09472 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EP300Q09472 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EP300Q09472 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EP300Q09472 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EP300Q09472 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EP300Q09472 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EP300Q09472 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EP300Q09472 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EP300Q09472 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EP300Q09472 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EP300Q09472 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EP300Q09472 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EP300Q09472 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EP300Q09472 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EP300Q09472 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EP300Q09472 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
EP300Q09472 AL020996.1-201ENST00000442055 435 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EP300Q09472 AC069208.1-205ENST00000456299 576 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EP300Q09472 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EP300Q09472 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EP300Q09472 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EP300Q09472 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EP300Q09472 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EP300Q09472 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EP300Q09472 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EP300Q09472 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EP300Q09472 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EP300Q09472 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
EP300Q09472 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EP300Q09472 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EP300Q09472 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
EP300Q09472 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EP300Q09472 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EP300Q09472 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EP300Q09472 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EP300Q09472 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EP300Q09472 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EP300Q09472 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EP300Q09472 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EP300Q09472 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EP300Q09472 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EP300Q09472 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EP300Q09472 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
EP300Q09472 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EP300Q09472 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EP300Q09472 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EP300Q09472 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EP300Q09472 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EP300Q09472 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EP300Q09472 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EP300Q09472 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EP300Q09472 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EP300Q09472 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EP300Q09472 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms