Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms