Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC9.13□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 EIF5AP2-201ENST00000585668 1047 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC9.13□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.13□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC9.13□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC9.13□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC9.13□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 SLC25A21-203ENST00000555449 1023 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC9.13□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC9.12□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
LRP1Q07954 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms