Protein–RNA interactions for Protein: Q07864

POLE, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 2,286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLEQ07864 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC14.03□□□□□ -0.16
POLEQ07864 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
POLEQ07864 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
POLEQ07864 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
POLEQ07864 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
POLEQ07864 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
POLEQ07864 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
POLEQ07864 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
POLEQ07864 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
POLEQ07864 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
POLEQ07864 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
POLEQ07864 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
POLEQ07864 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.16
POLEQ07864 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.16
POLEQ07864 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
POLEQ07864 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
POLEQ07864 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
POLEQ07864 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
POLEQ07864 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
POLEQ07864 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
POLEQ07864 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
POLEQ07864 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
POLEQ07864 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.16
POLEQ07864 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
POLEQ07864 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
POLEQ07864 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
POLEQ07864 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.16
POLEQ07864 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
POLEQ07864 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
POLEQ07864 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
POLEQ07864 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
POLEQ07864 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
POLEQ07864 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
POLEQ07864 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
POLEQ07864 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
POLEQ07864 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC14.02□□□□□ -0.16
POLEQ07864 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
POLEQ07864 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
POLEQ07864 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
POLEQ07864 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
POLEQ07864 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
POLEQ07864 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
POLEQ07864 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
POLEQ07864 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
POLEQ07864 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
POLEQ07864 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
POLEQ07864 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
POLEQ07864 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
POLEQ07864 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
POLEQ07864 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
POLEQ07864 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
POLEQ07864 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
POLEQ07864 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.02□□□□□ -0.17
POLEQ07864 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
POLEQ07864 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
POLEQ07864 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
POLEQ07864 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
POLEQ07864 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
POLEQ07864 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
POLEQ07864 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
POLEQ07864 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
POLEQ07864 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
POLEQ07864 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
POLEQ07864 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
POLEQ07864 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
POLEQ07864 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
POLEQ07864 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
POLEQ07864 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
POLEQ07864 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
POLEQ07864 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
POLEQ07864 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
POLEQ07864 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
POLEQ07864 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
POLEQ07864 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
POLEQ07864 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
POLEQ07864 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
POLEQ07864 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
POLEQ07864 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
POLEQ07864 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
POLEQ07864 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
POLEQ07864 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
POLEQ07864 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
POLEQ07864 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
POLEQ07864 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC14.01□□□□□ -0.17
POLEQ07864 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
POLEQ07864 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
POLEQ07864 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
POLEQ07864 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
POLEQ07864 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
POLEQ07864 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
POLEQ07864 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
POLEQ07864 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
POLEQ07864 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
POLEQ07864 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
POLEQ07864 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
POLEQ07864 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
POLEQ07864 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
POLEQ07864 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
POLEQ07864 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
POLEQ07864 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms