Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
DEUP1Q05D60 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DEUP1Q05D60 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DEUP1Q05D60 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DEUP1Q05D60 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DEUP1Q05D60 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DEUP1Q05D60 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DEUP1Q05D60 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DEUP1Q05D60 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DEUP1Q05D60 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DEUP1Q05D60 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DEUP1Q05D60 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
DEUP1Q05D60 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
DEUP1Q05D60 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
DEUP1Q05D60 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.64■□□□□ 0.26
DEUP1Q05D60 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
DEUP1Q05D60 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
DEUP1Q05D60 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms