Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms