Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPN12Q05209 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms