Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms