Protein–RNA interactions for Protein: Q02297

NRG1, Pro-neuregulin-1, membrane-bound isoform, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRG1Q02297 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NRG1Q02297 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NRG1Q02297 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NRG1Q02297 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NRG1Q02297 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NRG1Q02297 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NRG1Q02297 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NRG1Q02297 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NRG1Q02297 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NRG1Q02297 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NRG1Q02297 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NRG1Q02297 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NRG1Q02297 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NRG1Q02297 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NRG1Q02297 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NRG1Q02297 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NRG1Q02297 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NRG1Q02297 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NRG1Q02297 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NRG1Q02297 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NRG1Q02297 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NRG1Q02297 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NRG1Q02297 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NRG1Q02297 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NRG1Q02297 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NRG1Q02297 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NRG1Q02297 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NRG1Q02297 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NRG1Q02297 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NRG1Q02297 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NRG1Q02297 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NRG1Q02297 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NRG1Q02297 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NRG1Q02297 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NRG1Q02297 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NRG1Q02297 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NRG1Q02297 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NRG1Q02297 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NRG1Q02297 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NRG1Q02297 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NRG1Q02297 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NRG1Q02297 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NRG1Q02297 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NRG1Q02297 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NRG1Q02297 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NRG1Q02297 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NRG1Q02297 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NRG1Q02297 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NRG1Q02297 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NRG1Q02297 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NRG1Q02297 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NRG1Q02297 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NRG1Q02297 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NRG1Q02297 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NRG1Q02297 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NRG1Q02297 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
NRG1Q02297 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
NRG1Q02297 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NRG1Q02297 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NRG1Q02297 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
NRG1Q02297 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NRG1Q02297 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
NRG1Q02297 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
NRG1Q02297 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NRG1Q02297 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
NRG1Q02297 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NRG1Q02297 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NRG1Q02297 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NRG1Q02297 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NRG1Q02297 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NRG1Q02297 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NRG1Q02297 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NRG1Q02297 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NRG1Q02297 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NRG1Q02297 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NRG1Q02297 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NRG1Q02297 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NRG1Q02297 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NRG1Q02297 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NRG1Q02297 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NRG1Q02297 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NRG1Q02297 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NRG1Q02297 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NRG1Q02297 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NRG1Q02297 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NRG1Q02297 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NRG1Q02297 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NRG1Q02297 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NRG1Q02297 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NRG1Q02297 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NRG1Q02297 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NRG1Q02297 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NRG1Q02297 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NRG1Q02297 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NRG1Q02297 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NRG1Q02297 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NRG1Q02297 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NRG1Q02297 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NRG1Q02297 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NRG1Q02297 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.9 ms