Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
XPCQ01831 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
XPCQ01831 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
XPCQ01831 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
XPCQ01831 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
XPCQ01831 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
XPCQ01831 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
XPCQ01831 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
XPCQ01831 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
XPCQ01831 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
XPCQ01831 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
XPCQ01831 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
XPCQ01831 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
XPCQ01831 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
XPCQ01831 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
XPCQ01831 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
XPCQ01831 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
XPCQ01831 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
XPCQ01831 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
XPCQ01831 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
XPCQ01831 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
XPCQ01831 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
XPCQ01831 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
XPCQ01831 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
XPCQ01831 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
XPCQ01831 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
XPCQ01831 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
XPCQ01831 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
XPCQ01831 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
XPCQ01831 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
XPCQ01831 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
XPCQ01831 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
XPCQ01831 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
XPCQ01831 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
XPCQ01831 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
XPCQ01831 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
XPCQ01831 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
XPCQ01831 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
XPCQ01831 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
XPCQ01831 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
XPCQ01831 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
XPCQ01831 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
XPCQ01831 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
XPCQ01831 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
XPCQ01831 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
XPCQ01831 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
XPCQ01831 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
XPCQ01831 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
XPCQ01831 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
XPCQ01831 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
XPCQ01831 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
XPCQ01831 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
XPCQ01831 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
XPCQ01831 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
XPCQ01831 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
XPCQ01831 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
XPCQ01831 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
XPCQ01831 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
XPCQ01831 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
XPCQ01831 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
XPCQ01831 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
XPCQ01831 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
XPCQ01831 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
XPCQ01831 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
XPCQ01831 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
XPCQ01831 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
XPCQ01831 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
XPCQ01831 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
XPCQ01831 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
XPCQ01831 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
XPCQ01831 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
XPCQ01831 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.33■■□□□ 1
XPCQ01831 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
XPCQ01831 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
XPCQ01831 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
XPCQ01831 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
XPCQ01831 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
XPCQ01831 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
XPCQ01831 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
XPCQ01831 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
XPCQ01831 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
XPCQ01831 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
XPCQ01831 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
XPCQ01831 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
XPCQ01831 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
XPCQ01831 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
XPCQ01831 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
XPCQ01831 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC21.32■■□□□ 1
XPCQ01831 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
XPCQ01831 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC21.32■■□□□ 1
XPCQ01831 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC21.32■■□□□ 1
XPCQ01831 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
XPCQ01831 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
XPCQ01831 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
XPCQ01831 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
XPCQ01831 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
XPCQ01831 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC21.32■■□□□ 1
XPCQ01831 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
XPCQ01831 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
XPCQ01831 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms